土壤环境质量标准是土壤中污染物的容许含量。污染物在土壤中的残留积累，以不致造成作物的生育障碍、在籽粒或可食部分中的过量积累(不超过食品卫生标准)或影响土壤、水体等环境质量为界限。为贯彻《中华人民共和国环境保护》防止土壤污染，保护生态环境，保障农林生产，维护人体健康，制定本标准。按土壤应用功能、保护目标和土壤主要性质，规定了土壤中污染物的允许浓度指标值及相应的监测方法。
| 检测类型 | 检测指标 | |
| 常规项目 | 理化检测指标 | PH、水分、酸度、容重、密度、粒度、挥发酚、氟化物、氰化物、氨氮、全氮、全磷、全钾、硝酸盐氮、全盐量、硫酸根、有效磷、有效硅、有效铁、有效硼、钾、阳离子交换量、有机质等 |
| 金属检测指标 | 铅、镉、汞、铬、锑、砷、铍、硒、铜、镍、银、锌、锰、铝、锂、钡、钛、锡、硼、锶、钴、钼、钍、铀、钒、铋、镓、锗、碲、铊等 | |
| 有机检测指标 | 挥发性卤代烃、挥发性总石油类烃、多氯联苯、多环芳径、可提取有机卤化物、挥发性有机物、半挥发性有机物、有机氯农药、有机磷农药(速灭磷、甲拌磷、二嗪磷、异稻瘟净、甲基对硫磷、杀螟硫磷、溴硫磷 、稻丰散、杀扑磷)等 | |
| 科研课题项目 | 土壤生物学指标 | 菌落总数、大肠菌群、大肠杆菌、霉菌、酵母菌等各类常规微生物、肠杆菌科、嗜渗酵母、粪链球菌、粪大肠菌群、肠杆菌属等非常规微生物、微生物量碳、微生物量氮、生物多样性等、脲酶、过氧化氢酶、磷酸酶、蔗糖酶、纤维素酶、蛋白酶等、有机质、胡敏酸、富里酸、腐殖质 |
| 土壤污染物指标 | 各类农药残留检测、各类抗生素检测 | |
| 土壤营养指标 | 有机质、全氮、钾磷、氮、酸碱度、碳氮比、阳离子交换量 | |
| 土壤重金属元素分析 | 土壤45项检测项目 | |
| 土壤代谢组学分析 | 土壤中各类代谢物分析 | |